Choisir un logiciel de facturation en 2026 n’est plus un choix anodin. Avec la réforme de la facture électronique qui devient obligatoire dès septembre 2026 pour les grandes entreprises et ETI, et en septembre 2027 pour les TPE/PME, toutes les entreprises assujetties à la TVA vont devoir passer par une Plateforme Agréée (PA) — l’unique moyen légal de recevoir et d’émettre des factures électroniques en France.

La bonne nouvelle ? De nombreux éditeurs de logiciels de facturation français se sont fait immatriculer par la DGFiP, et proposent aujourd’hui des solutions qui combinent facturation, comptabilité, CRM et conformité PA. Mauvaise nouvelle : beaucoup d’outils populaires ne sont pas encore Plateforme Agréée — et devront passer par un partenaire pour rester utilisables après 2027.

Alors quel logiciel de facturation choisir aujourd’hui pour être prêt demain ? Pour vous aider à trancher, j’ai sélectionné les 15 meilleurs logiciels de facturation professionnels en 2026, tous Plateformes Agréées officielles par la DGFiP. C’est parti !

Comprendre la facture électronique et les Plateformes Agréées (PA)

Avant de plonger dans le comparatif, un point réglementaire indispensable. À partir de septembre 2026, toutes les entreprises françaises assujetties à la TVA doivent pouvoir recevoir des factures électroniques. À partir de septembre 2027, toutes les TPE/PME doivent aussi pouvoir les émettre. Les factures PDF envoyées par mail ne seront plus reconnues légalement entre professionnels.

Pour cela, les entreprises doivent passer par une Plateforme Agréée (PA) — anciennement appelée « PDP » (Plateforme de Dématérialisation Partenaire). C’est une plateforme immatriculée officiellement par la DGFiP qui assure la transmission, la conformité et l’archivage des factures entre vendeurs et acheteurs.

Concrètement, choisir aujourd’hui un logiciel de facturation déjà immatriculé PA (ou intégré à une PA), c’est s’assurer d’une continuité sans migration forcée en 2027. Tous les logiciels de notre sélection 2026 sont des Plateformes Agréées officielles, vérifiées sur la liste publiée par la DGFiP au 4 avril 2026.

1. Indy

Indy est le logiciel de facturation et de comptabilité français de référence pour les freelances, micro-entrepreneurs et indépendants. La force d’Indy, c’est une approche radicalement simple : vous créez vos devis et factures en quelques clics, la compta se fait en arrière-plan, et vous déclarez votre TVA en 3 minutes. Le logiciel est gratuit pour la partie facturation, ce qui en fait une porte d’entrée imbattable.

Je l’apprécie particulièrement pour :

• Interface ultra-intuitive, pas besoin d’être comptable
• Synchronisation bancaire automatique avec toutes les grandes banques françaises
• Compta pilotée en autonomie avec assistance humaine si besoin
• Déclaration de TVA en 3 minutes — unique sur le marché
• Immatriculation PA officielle pour la facture électronique 2027

Combien ça coûte ? Facturation gratuite à vie. La formule complète (compta + TVA) démarre à 12 €/mois.

✅ Plateforme Agréée par la DGFiP — conforme à la réforme de la facture électronique.

2. Pennylane

Pennylane est la plateforme française tout-en-un qui fait le lien entre l’entrepreneur et son expert-comptable. Lancée en 2020, la startup a levé plus de 450 millions d’euros et équipe aujourd’hui plus de 250 000 entreprises en France et en Europe. La proposition de valeur : centraliser facturation, comptabilité, trésorerie et pilotage dans un seul outil moderne, connecté à tous vos comptes pro.

Ce qui fait la force de Pennylane :

• Collaboration fluide avec l’expert-comptable — la référence pour les PME qui veulent externaliser leur compta
• Synchronisation bancaire avec 300+ banques européennes
• Automatisation poussée (OCR, pré-comptabilisation, relances)
• Pilotage cash flow en temps réel avec prévisionnel de trésorerie
• PA officielle depuis décembre 2025 — l’une des premières immatriculées

Combien ça coûte ? À partir de 19 €/mois (plan Starter). Formules avancées de 49 € à 99 €/mois selon les besoins.

✅ Plateforme Agréée par la DGFiP — conforme à la réforme de la facture électronique.

3. Axonaut

Axonaut est le CRM + facturation + compta français pensé pour les TPE et PME qui veulent tout piloter dans un seul outil. Basée à Toulouse, l’entreprise équipe plus de 70 000 entrepreneurs et se distingue par une offre ultra-complète à un tarif très compétitif. Facturation, devis, relances, CRM, trésorerie, notes de frais, gestion commerciale : tout est intégré nativement.

Les atouts qui font la différence :

• Véritable suite de gestion (CRM + facturation + compta) en un seul abonnement
• Relances automatiques intelligentes par email et SMS
• Signature électronique des devis incluse
• Interface française, support réactif, hébergement 100 % France
• Plateforme Agréée par la DGFiP

Combien ça coûte ? À partir de 41,99 €/mois (tout inclus), sans engagement, avec essai gratuit de 15 jours.

✅ Plateforme Agréée par la DGFiP — conforme à la réforme de la facture électronique.

4. Sellsy

Sellsy est une suite française complète de CRM + facturation + pré-comptabilité pensée pour les PME en croissance. Fondée à La Rochelle, Sellsy équipe plus de 22 000 entreprises et se positionne sur un segment plus mature qu’Axonaut, avec des fonctionnalités poussées en prospection, pipeline commercial et marketing automation.

Ce qui distingue Sellsy :

• CRM de niveau entreprise avec automation, segmentation, lead scoring
• Facturation évoluée : abonnements récurrents, multi-devises, multi-sociétés
• Marketing automation intégré (emails, sms, campagnes multi-touch)
• Pilotage commercial avancé avec tableaux de bord personnalisables
• Plateforme Agréée DGFiP immatriculée

Combien ça coûte ? À partir de 39 €/mois/utilisateur. Plans avancés jusqu’à 89 €/mois pour les fonctions commerciales et marketing les plus poussées.

✅ Plateforme Agréée par la DGFiP — conforme à la réforme de la facture électronique.

5. Tiime

Tiime est une solution française mobile-first spécialement conçue pour les TPE, freelances et indépendants qui travaillent en déplacement. Le logiciel combine facturation, notes de frais et comptabilité collaborative avec l’expert-comptable, le tout accessible depuis un smartphone avec une expérience utilisateur très soignée.

Les points forts de Tiime :

• Application mobile excellente — prise de photo, scan de tickets de caisse, création de factures en mobilité
• Collaboration fluide avec l’expert-comptable via Tiime Apps
• Gestion des notes de frais intégrée avec OCR automatique
• Synchronisation bancaire en temps réel
• Plateforme Agréée DGFiP (Tiime PDP)

Combien ça coûte ? Offre Facturation gratuite. Les offres Business et Premium (incluant compta) démarrent à 49 €/mois.

✅ Plateforme Agréée par la DGFiP — conforme à la réforme de la facture électronique.

6. Qonto

Qonto est la néobanque pro de référence en Europe, avec plus de 600 000 clients pros dans 4 pays. Mais Qonto ne se limite plus au compte pro : l’intégration d’un module de facturation complet en fait désormais une plateforme tout-en-un, idéale pour les entrepreneurs qui veulent gérer leurs finances et facturer depuis un seul outil.

Ce qui rend Qonto incontournable :

• Compte pro + facturation dans une seule interface fluide
• Rapprochement bancaire automatique : la facture est marquée payée dès que l’argent arrive
• Relances automatisées en cas d’impayés
• Cartes physiques et virtuelles incluses pour l’équipe
• Plateforme Agréée par la DGFiP — figure parmi les premières immatriculées

Combien ça coûte ? À partir de 11 €/mois HT (Basic) ; plans Smart (21 €), Premium (39 €) et Essential (99 €) selon les fonctionnalités.

✅ Plateforme Agréée par la DGFiP — conforme à la réforme de la facture électronique.

7. Dougs Facturation gratuite

Dougs est un cabinet d’expertise comptable nouvelle génération qui propose, en plus de ses services, un logiciel de facturation 100 % gratuit à tous les entrepreneurs français. C’est une porte d’entrée parfaite pour les TPE qui veulent s’équiper d’une solution conforme sans dépenser un euro, tout en gardant la possibilité de souscrire à leur offre de compta complète si besoin.

Pourquoi choisir Dougs Facturation :

• 100 % gratuit, sans limitation de factures ou de clients
• Devis, factures, acomptes, avoirs — toutes les bases couvertes
• Relances automatiques et paiement en ligne intégré
• Prolongement naturel vers l’offre compta Dougs si besoin
• Plateforme Agréée par la DGFiP

Combien ça coûte ? Facturation 100 % gratuite à vie. La compta complète avec accompagnement démarre à 69 €/mois HT.

✅ Plateforme Agréée par la DGFiP — conforme à la réforme de la facture électronique.

8. ABBY

ABBY est le compagnon des auto-entrepreneurs et indépendants. Basée à Nancy, la startup équipe plus de 500 000 micro-entrepreneurs français avec une solution taillée sur-mesure pour ce statut : facturation URSSAF-compliant, suivi du chiffre d’affaires, déclarations automatisées, relances intelligentes.

Ce qui séduit chez ABBY :

• Ultra-spécialisé auto-entrepreneurs — tout est pensé pour ce statut
• Déclarations URSSAF automatisées en quelques clics
• Suivi du seuil de TVA avec alertes avant dépassement
• Interface moderne, accessible sur web et mobile
• Plateforme Agréée DGFiP

Combien ça coûte ? Version gratuite disponible. Formules Premium et Pro de 6 € à 18 €/mois selon les fonctionnalités.

✅ Plateforme Agréée par la DGFiP — conforme à la réforme de la facture électronique.

9. Solo

Solo est le compte pro + facturation nouvelle génération pensé pour les freelances modernes. Créé en 2020, Solo combine compte bancaire, carte, facturation conforme, suivi des revenus et déclarations fiscales dans une application mobile ultra-léchée. La cible : les indépendants qui veulent une stack simple et moderne.

Les atouts de Solo :

• Tout-en-un freelance : compte pro + facturation + déclarations
• Design mobile exceptionnel, utilisation au quotidien agréable
• Onboarding express : création de compte en 10 minutes
• Déclarations URSSAF/TVA assistées
• Plateforme Agréée DGFiP

Combien ça coûte ? À partir de 14 €/mois pour l’offre Solo, avec carte physique incluse et facturation illimitée.

✅ Plateforme Agréée par la DGFiP — conforme à la réforme de la facture électronique.

10. Sage

Sage est l’un des plus grands éditeurs mondiaux de logiciels de gestion, avec plusieurs millions d’entreprises clientes. Sa gamme Sage 50 et Sage 100 couvre l’ensemble des besoins de gestion des PME et ETI : facturation, comptabilité, paie, gestion commerciale, pilotage. Un choix robuste pour les structures qui ont dépassé le stade artisanal.

Ce qui fait la force de Sage :

• Solution éprouvée depuis 40 ans, taillée pour les PME/ETI
• Gamme complète : facturation, compta, paie, gestion commerciale
• Puissance et profondeur fonctionnelle inégalées sur ce segment
• Large réseau de partenaires intégrateurs
• Plateforme Agréée par la DGFiP

Combien ça coûte ? Sage 50 démarre autour de 40 €/mois ; Sage 100 (plus complet) sur devis selon la taille et les modules.

✅ Plateforme Agréée par la DGFiP — conforme à la réforme de la facture électronique.

11. Cegid

Cegid est le grand éditeur français des PME et ETI, avec une gamme qui inclut Evoliz (facturation TPE/PME), Quadratus (compta experts-comptables), Cegid XRP et plus. Avec 500 000 clients dans 130 pays, Cegid est le concurrent historique de Sage sur le marché français, et propose des solutions de facturation adaptées à chaque taille d’entreprise.

Pourquoi considérer Cegid :

• Gamme étendue selon votre taille (TPE avec Evoliz, PME/ETI avec Cegid)
• Leader français avec un écosystème comptable profond
• Intégrations avec la plupart des cabinets d’expertise comptable
• Solutions sectorielles : retail, BTP, professions libérales
• Plateforme Agréée DGFiP au niveau groupe

Combien ça coûte ? Evoliz démarre à 14 €/mois. Cegid pour PME/ETI : sur devis selon les modules.

✅ Plateforme Agréée par la DGFiP — conforme à la réforme de la facture électronique.

12. Macompta.fr

Macompta.fr est un logiciel français simple et économique, apprécié particulièrement par les TPE, commerçants et associations. Basé à Lagord (Charente-Maritime), l’éditeur propose depuis plus de 15 ans une suite complète compta + facturation à tarif très accessible, avec un support français réactif.

Les forces de Macompta.fr :

• Tarif imbattable — l’un des meilleurs rapports qualité/prix du marché
• Simplicité de prise en main, idéal pour les non-comptables
• Adapté aux associations (gestion des adhérents, comptabilité loi 1901)
• Support français par téléphone et email
• Plateforme Agréée DGFiP

Combien ça coûte ? Version d’essai gratuite. Offres payantes à partir de 10 €/mois, avec des paliers selon la taille de l’entreprise.

✅ Plateforme Agréée par la DGFiP — conforme à la réforme de la facture électronique.

13. VosFactures

VosFactures est un logiciel de facturation disponible en plus de 20 langues, idéal pour les entrepreneurs qui facturent à l’international. Utilisé dans plus de 180 pays, il combine simplicité et multilinguisme, tout en étant désormais immatriculé Plateforme Agréée pour la conformité française.

Les particularités de VosFactures :

• Multilingue et multi-devises — un atout clé pour l’export
• Gestion des stocks intégrée pour les e-commerçants
• Abonnements récurrents et facturation automatique
• API complète pour les connexions custom
• Plateforme Agréée DGFiP

Combien ça coûte ? Version gratuite (3 factures/mois). Forfaits payants de 9 €/mois (Basic) à 45 €/mois (Premium) selon le volume.

✅ Plateforme Agréée par la DGFiP — conforme à la réforme de la facture électronique.

14. iPaidThat

iPaidThat est une solution française tout-en-un qui combine facturation, notes de frais, reçus et pré-comptabilité. Basée à Saint-Grégoire (Bretagne), la startup cible les TPE et PME qui cherchent à automatiser au maximum la gestion administrative grâce à l’OCR et l’IA.

Ce qui fait l’intérêt d’iPaidThat :

• OCR puissant pour scanner reçus, tickets et factures fournisseurs
• Facturation + notes de frais dans un seul outil
• Collecte automatique des factures depuis les mailbox et SaaS
• Pré-comptabilisation automatisée pour gagner du temps
• Plateforme Agréée par la DGFiP

Combien ça coûte ? À partir de 14,90 €/mois (Starter) jusqu’à 49 €/mois selon les fonctionnalités.

✅ Plateforme Agréée par la DGFiP — conforme à la réforme de la facture électronique.

15. Yooz

Yooz est le spécialiste français de la dématérialisation des factures fournisseurs, avec plus de 5 000 clients et 15 000 utilisateurs. Son positionnement est plus orienté PME et ETI qui reçoivent un fort volume de factures fournisseurs à traiter, avec une technologie d’IA avancée pour automatiser extraction, validation, comptabilisation et paiement.

Pourquoi choisir Yooz :

• Automatisation poussée de la chaîne fournisseur (achats, factures, paiement)
• IA d’extraction parmi les plus performantes du marché
• Workflows de validation configurables selon votre organisation
• Intégration avec 250+ ERP et logiciels de compta
• Plateforme Agréée DGFiP (Yooz PDP)

Combien ça coûte ? Tarification sur devis selon le volume de factures traitées et les intégrations nécessaires.

✅ Plateforme Agréée par la DGFiP — conforme à la réforme de la facture électronique.

Comment choisir son logiciel de facturation en 2026 ?

Avec 15 solutions toutes conformes à la réglementation, le choix ne se fait plus sur la conformité mais sur l’adéquation entre le logiciel et votre profil d’entreprise. Voici mes 6 critères clés pour décider.

Votre statut et votre taille

C’est le premier filtre. Un auto-entrepreneur n’a pas les mêmes besoins qu’une PME de 50 salariés. Si vous êtes seul ou freelance, privilégiez une solution simple et abordable (Indy, Tiime, Solo, ABBY). Si vous êtes une TPE/PME, optez pour une suite plus large (Axonaut, Pennylane, Sellsy). Au-delà, regardez Sage ou Cegid.

Les fonctionnalités dont vous avez besoin

Une simple émission de devis et factures ? Dougs, Tiime, Macompta feront le job pour un coût modeste. Besoin de CRM commercial, d’un pipeline de ventes, de relances automatisées ? Tournez-vous vers Axonaut ou Sellsy. Vous recevez beaucoup de factures fournisseurs ? Yooz ou iPaidThat sont spécialisés sur ce flux.

L’intégration avec votre expert-comptable

Si vous travaillez déjà avec un expert-comptable, vérifiez ce qu’il utilise comme outil. Pennylane, Tiime, Dougs, Cegid et Sage sont les plus courants côté cabinets comptables — choisir dans cette gamme facilite énormément la collaboration et réduit vos honoraires.

L’ergonomie et la prise en main

Un logiciel de facturation, c’est un outil du quotidien. Une interface claire vous fera gagner des heures par semaine. Indy, ABBY, Solo, Qonto ont les interfaces les plus modernes et intuitives. Sage et Cegid sont plus denses — c’est le revers de leur profondeur fonctionnelle.

La gestion des paiements et des relances

Un bon logiciel doit vous faire gagner de l’argent en accélérant vos encaissements. Vérifiez la présence de : paiement en ligne intégré (Stripe, GoCardless), relances automatiques par email/SMS, rapprochement bancaire automatique. Axonaut, Qonto, Pennylane sont particulièrement forts sur ce point.

Le budget

Les prix varient de 0 € (Indy Facturation, Dougs, Tiime Facturation, ABBY Free) à plusieurs centaines d’euros par mois pour les suites complètes. Pour une TPE qui démarre, commencez par une offre gratuite et montez en gamme quand le volume et la complexité le justifient.

Mes recommandations selon votre profil

Vous êtes auto-entrepreneur ou freelance

→ Indy (gratuit), ABBY ou Solo. Ces trois outils sont taillés pour votre statut, avec automatisation des déclarations URSSAF et TVA. Indy est le plus robuste côté compta, ABBY le plus complet pour la micro, Solo le plus moderne.

Vous êtes une TPE (1 à 10 salariés)

→ Axonaut si vous voulez tout piloter (CRM + facturation + compta), Qonto si vous voulez combiner compte pro et facturation, Dougs ou Macompta si le budget est serré, Tiime si vous travaillez en mobilité.

Vous êtes une PME en croissance

→ Pennylane pour la collaboration avec l’expert-comptable, Sellsy si le CRM commercial est critique, Cegid/Evoliz ou Sage 50 si vous avez des besoins de gestion plus profonds.

Vous êtes une ETI ou un groupe

→ Sage ou Cegid pour la suite complète, Yooz pour automatiser la gestion des factures fournisseurs.

Vous facturez à l’international

→ VosFactures pour le multilingue/multi-devises, ou Pennylane / Qonto qui gèrent désormais très bien l’international.

Ce qu’il faut retenir

Trois points essentiels à garder en tête pour choisir votre logiciel de facturation en 2026 :

• La conformité PA n’est plus négociable — tous les logiciels présentés dans ce comparatif sont officiellement immatriculés par la DGFiP, ce qui vous garantit une continuité jusqu’en 2027 et au-delà
• Le bon choix dépend de votre taille et de vos besoins — un auto-entrepreneur n’a rien à faire sur Sage, et une ETI n’a aucun intérêt à utiliser ABBY
• Testez avant de vous engager — la plupart des solutions proposent un essai gratuit de 15 à 30 jours. Profitez-en pour valider le choix avant de migrer vos données

La bonne nouvelle, c’est que la France dispose aujourd’hui de l’un des écosystèmes de logiciels de facturation les plus riches et les plus performants du monde. Peu importe votre profil, il existe un outil parfaitement adapté à votre activité — et qui vous rendra conforme à la réforme de la facture électronique sans effort.

Source : Liste officielle des Plateformes Agréées (PA) publiée par la DGFiP, mise à jour au 4 avril 2026.